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大家是否都有过这样的经历，天天焦急地刷新投稿系统，终于等到了审稿意见，但看到其中一些意见时，却感到头脑嗡嗡作响，感觉无从下手……

今天我们就用Nature子刊的回复实例，手把手教你如何回复审稿意见。

1 回复原则复习

◆ 每一封信都需要有主题，让审稿人第一时间知道这封信的用意，可以参考如下示例。

◆ 逐条回复审稿意见，不要遗漏。

◆ 如果意见合理，要仔细修改；如果意见不合理，也要委婉的解释原因，用文献佐证。

◆ 逻辑清楚，不要过度解读将问题变得复杂。

◆ 一定要注明你在哪里修改了稿件。

2 本期案例分析

逐条回复审稿意见时，首先，感谢审稿人的意见；然后，针对具体问题逐一回复，本期内容以下面三个情景为例，讲述作者回复审稿意见的思路：

1） 需要补充实验数据

“作者能否提供……表达模式？此外，OsMYB8表达水平的升高是否有助于籼稻品种的小花开放时间提前？我强烈建议作者对……和……在小花开放期间OsMYB8的时空表达水平进行比较分析。”

回复思路：

首先感谢审稿人提出的宝贵建议。然后为了解决这些问题，作者通过……分析比较了OsMYB8在……和……不同时间点的表达水平，包括开花前一天18:00和开花当天的多个时间点……针对这一问题，作者主要通过补充实验数据进行了回复。

第一步：通过比较分析……，结果表明，OsMYB8的表达量在小花开放前一天较低，随着开放时间的增加逐渐增加，之后逐渐降低。

第二步：此外，我们发现OsMYB8在……中的表达量在开花前显著高于……。这些结果表明，……表达水平升高，可能是导致不同品种开花时间提前的原因。

第三步：结果显示在新的附加材料图5中，并在line183-193中进行了描述……

2） 质疑论文某些内容是否多余

“我有一些具体的改进建议：从图S3来看，似乎还有另一个OsMYB与OsMYB8和两个介导花中茉莉酸反应的拟南芥myb在同一组中相似。如果能展示……的表达模式，……，它是否会使OsMYB8多余? ”

回复思路：

感谢审稿人的的建议。根据审稿人的建议，作者检测了OsMYB8样基因在不同组织中的转录水平，包括根、茎、叶、穗和花器官(外稃、稃、雄蕊、雌蕊和小叶)……这个回复的重点是消除审稿人的疑惑，因此，作者主要还是要进行实验补充或者举例论证……

第一步：相比之下， OsMYB8样基因在雄蕊中高表达，在小叶中不表达(ResponseFig.5)。

第二步：此外，我们使用gricevarmap2对OsMYB8-like的单倍型进行了分析，(http://ricevarmap.ncpgr.cn/hap_net/)，发现籼稻和粳稻品种之间没有明显的差异。

第三步：因此，我们的研究重点是OsMYB8。所以，它并不多余。

3） 论文结论有些局限性

审稿人首先肯定了论文的研究内容……但同时表达了论文的结论有局限性。审稿人建议作者详细阐述一些科学上有趣的观点，其中一个点可能是，花的时间是受茉莉酸控制的。然而，……这些表型在本文研究的OsMYB8突变体中没有描述，因此水稻在花发育的不同阶段利用……，包括抽穗时间、花形态、花药开裂、花开放等。OsMYB8似乎是花开的关键，但不是其他步骤(包括花落)的关键。在我看来，这一点在讨论中并没有得到充分的解释。我甚至建议扩展结果，以显示除……的调控模式，例如……在WT和OsMYB8之间受到差异调控。

回复思路：

感谢审稿人的真知灼见。首先表明作者对OsMYB8与茉莉酸盐(JA)之间的联系进行了更全面的讨论，这也是Reviewer #1提出的。同时，感谢审稿人提供了这些参考文献。作者主要做的是补充一些文献的结论以丰富本论文的结论，对论文的结论进行补充……

第一步：在仔细阅读文献后，我们认为OsMYB8与JA生物合成和信号传导相关基因的主要区别在于OsMYB8主要控制小花开放时间，因为OsMYB8突变体在小穗形态、花药开裂和育性方面没有显着改变。提出结论，因此，OsMYB8是改良水稻DFOT的优良基因源。同时，结论已添加到修订后的讨论部分……

这里首先回应OsMYB8突变体中没有描述这一问题。对OsMYB8是花朵开放的关键，但不是其他步骤的关键作出回应。

第二步：根据审稿人的建议，我们对OsJAR2promoter进行了序列分析，发现其启动子中存在多个"TTHGGY"基序。然而，基于不同时间点的TFB和ZH11小泡的RNA-seq数据，我们发现OsJAR2在小泡中的表达水平非常低或无法检测到……；这里再次对结论进行充分的解释。

第三步：此外，已有研究报道……是水稻小花中催化JA-Ile形成的主要酶33。因此，我们在本研究中重点研究了OsJAR1，再次表明我们的论点论据是充足的，打消审稿人顾虑。

4） 建议找母语专家润色论文语言

有时候在审稿意见的最后，作者会被建议：请专业润色公司或母语为英语的专家对论文语言进行润色。

Now, you are requested to send the revised manuscript to a professional English language editing company or a native English-speaking expert to polish the language further.

这可能是最好处理的问题了，作者可以联系埃米编辑，由美国本土专家编辑对论文进行专业润色，出具润色证明，并在致谢部分表示感谢，从而消除文章语言问题，助力最终成功发表。

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参考资料：

[1] https://www.nature.com/articles/s41467-024-46579-z